本书记载九寨沟国家自然保护区中藻类84属228种（含变种变型），其中硅藻55属186种；绿藻11属14种，蓝藻门7属10种；裸藻门1属5种；甲藻门3属3种；轮藻门1属3种；金藻门3属3种；黄藻门1属2种；隐藻门2属2种。硅藻是九寨沟藻类的主要类群，占总种数的80%以上，我们用酸处理的方法对硅藻进行了处理，在油镜下观察鉴定，部分种类浮游活体和扫描电镜照片；非硅藻种类较少，但它们常形成优势群落，构成九寨沟藻类的群落景观，我们对其生境及生长情况进行了拍照，对常见种进行了活体拍照。
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目录
1 蓝藻门Cyanophyta
色球藻纲Chroococcophyceae / 03
色球藻目Chroococcales / 03
色球藻科Chroococcaceae / 03
微囊藻属MicrocVstis / 03
隐球藻属Aphanocapsa / 05
隐杆藻属Aphanothece / 06
色球藻属Chroococcus / 07
平裂藻属Merismopedia / 09
腔球藻属Coelosphaerium / 10
束球藻属Gomphosphaeria / 11
藻殖段纲Hormogonophyceae / 12
伪枝藻目Scytonematales / 12
伪枝藻科Scytonemataceae / 12
织线藻属Plectonema / 12
单歧藻属Tolypothrix / 14
伪枝藻属Scytonema / 15
胶须藻目Rivulariales / 16
胶须藻科Rivulariaceae / 16
属藻属Calothrix / 16
双须藻属Dichothrix / 17
颤藻目Oscillatoriales / 19
颤藻科Oscillatoriaceae / 19
颤藻属Oscillatoria Vaucher 1803 / 19
席藻属Phormidium KutZing 1843 / 21
念珠藻目Nostocales / 22
念珠藻科Nostocaceae / 22
鱼腥藻属Anabaena / 22
念珠藻属Nostoc / 23
2 裸藻门Euglenophyta
裸藻纲Euglenophyta / 29
裸藻目Euglenales / 29
裸藻科Euglenaceae / 29
囊裸藻属Trachelomonas Ehrenberg / 29
扁裸藻属Phacus Dujardin 1841 / 32
3 绿藻门Chlorophyta
绿藻纲Chlorophyceae / 37
团藻目Volvocales / 37
团藻科Volvocaceae / 37
实球藻属Pandorina Bory 1824 / 37
四孢藻目Tetrasporales / 38
四孢藻科Tetrasporaceae / 38
梨囊藻属Apiocystis / 38
绿球藻目Chlorococcales / 39
小球藻科Chlorellaceae / 39
纤维藻属Ankistrodesmus / 39
卵囊藻科Oocystaceae / 40
卵囊藻属Oocystis / 40
胶囊藻属Gloeocystis / 41
盘星藻科Pediastraceae / 42
盘星藻属Pediastrum / 42
栅藻科Scenedesmaceae / 43
栅藻属Scenedesmus / 43
十字藻属Crucigenia / 44
空星藻属Coelastrum / 45
皮襟藻科Hormotilaceae / 46
掌网藻属Palmodictyon / 46
丝藻目Ulotrichales / 47
丝藻科Ulotrichaceae / 47
双胞藻属Geminella / 47
微孢藻科Microsporaceae / 48
微孢藻属Microspora / 48
筒藻科Cylindrocapsaceae / 49
筒藻属Cylindrocapsa / 49
胶毛藻目Chaetophorales / 50
隐毛藻科Aphanochaetaceae / 50
隐毛藻属Aphanochaete / 50
刚毛藻目Cladophorales / 51
刚毛藻科Cladophoraceae / 51
刚毛藻属Cladophora / 51
双星藻纲Zygnematophyceae / 52
双星藻目Zygnematales / 52
双星藻科Zygnemataceae / 52
双星藻属Zygnema / 52
膝接藻属Zygogonium / 53
转板藻属Mougeotia / 53
水绵属Spirogyra / 54
鼓藻目Desmidiales / 55
鼓藻科Desmidiaceae / 55
新月藻属Closterium / 55
宽带鼓藻属Pleurotaenium / 57
鼓藻属Cosmarium / 57
角星鼓藻属Staurastrum / 60
圆丝鼓藻属Hyalotheca / 61
4 轮藻门Charophyta
轮藻纲Charophyceae / 65
轮藻目Charales / 65
轮藻科Characeae / 65
轮藻属Chara / 65
5 甲藻门Dinophyta
甲藻纲Dinophyta / 71
多甲藻目Peridiniales / 71
裸甲藻科Gymnodiniaceae / 71
裸甲藻属Gymnodinium / 71
多甲藻科Peridiniaceae / 72
多甲藻属Peridinium / 72
角甲藻科Ceratiaceae / 73
角甲藻属Ceratium / 73
6 隐藻门Cryptophyta
隐藻纲Cryptophyceae / 77
隐藻目Cryptomonadales / 77
隐藻科Cryptomonadaceae / 77
蓝隐藻属Chroomonas / 77
隐藻属Cryptomonas / 77
7 金藻门Chrysophyta
金藻纲Chrysophyceae / 81
色金藻目Chromulinales / 81
锥囊藻科Dinobryonaceae / 81
锥囊藻属Dinobryon / 81
附钟藻属Epipyxis / 81
蛰居藻目Hibberdiales / 82
金柄藻科Stylococcaceae / 82
金钟藻属Chrysopyxis / 82
水树藻目Hydrurales / 83
水树藻科Hydruraceae / 83
水树藻属Hydrurus / 83
8 黄藻门Xanthophyta
黄藻纲Xanthophyceae / 87
杂球藻目Mischococcales / 87
黄管藻科Ophiocytiaceae / 87
黄管藻属Ophiocytium / 87
黄丝藻目Tribonematales / 88
黄丝藻科Tribonemataceae / 88
黄丝藻属Tribonema / 88
无隔藻目Vaucheriales / 88
无隔藻科Vaucheriaceae / 88
无隔藻属Vaucheria / 88
9 硅藻门Bacillariophyta
中心纲Centricae / 93
圆筛藻目Coscinodiscales / 93
圆筛藻科Coscinodiscaceae / 93
小环藻属Cyclotella / 93
碟星藻属Discostella / 96
琳达藻属Lindavia / 97
羽纹纲Pennatae / 100
无壳缝目Araphidinales / 100
脆杆藻科Fragilariaceae / 100
等片藻属Diatoma / 100
脆杆藻属Fragilaria / 104
汉氏藻属Hannaea / 107
假十字脆杆藻属Pseudostaurosira / 108
十字随机藻属Stauroszra / 110
窄十字脆杆藻属Staurosirella / 111
针轩藻属Synedra / 113
肘形藻属Ulnaria / 113
扇形藻属Meridion / 116
短壳缝目Raphidionales / 117
短缝藻科Eunotiaceae / 117
短缝藻属Eunotia / 117
单壳缝目Monoraphidinales / 119
曲壳藻科Achnanthaceae / 119
曲壳藻属Achnanthes / 119
曲丝藻属Achnanthidium / 120
平壳藻属Platessa / 121
真卵形藻属Eucocconeis Cleve 1895 / 122
卡氏藻属Karayevia / 125
平面藻属Planothidium / 126
钙丝藻属Rossithidium / 127
卵形藻科Cocconeidaceae / 128
卵形藻属Cocconeis / 128
双壳缝目Biraphidinales / 130
桥弯藻科Cymbellaceae / 130
双眉藻属Amphora / 130
海生双眉属Halamphora / 131
桥弯藻属Cymbella / 132
弯肋藻属Cymbopleura / 141
优美藻属Delicata / 145
内丝藻属Encyonema / 146
拟内丝藻属Encyonopsis / 148
瑞氏藻属Reimeria / 151
异极藻科Gomphonemaceae / 152
双楔藻属Didymosphenia / 152
异楔藻属Gomphoneis / 153
异极藻属Gomphonema / 154
中华异极藻属Gomphosinica / 161
舟形藻科Naviculaceae / 162
细小藻属Adlajia / 162
短纹藻属Brachysira / 163
美壁藻属Caloneis / 165
钩羽纹藻属Chamaepinnufaria / 168
双壁藻属Diploneis / 168
蹄形藻属Hippodonta / 170
胸隔藻属Mastogloia / 170
舟形藻属Navicula / 171
定舟藻属Naviculadicta / 178
长蓖形藻属Neidiomorpha / 178
长蓖藻属Neidium / 179
盘状藻属Ptaconeis / 180
羽纹藻属Pinnularia / 181
鞍型藻属Sellaphora / 183
四川藻属Sichuania / 186
辐节藻属Stauroneis / 187
管壳缝目Aulonoraphidinales / 189
菱形藻科Nitzschiaceae / 189
杆状藻属Bacillaria / 189
菱形藻属Nitzschia / 180
盘杆藻属Trybtioneua / 196
棒杆藻属Rhopalodia / 197
双菱藻目Surirellales / 198
双菱藻科Surirellaceae / 198
双菱藻属Surirella / 198
参考文献 / 200
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