本书包括“元代扬州的政治与军事”“元代扬州的经济、文化与社会生活”“明代扬州的政区与政局迁”“明代扬州的军事及其抗争”“明代扬州的经济(上)：农业与工商业”“明代扬州的经济(下)：盐业”“明代扬州的城乡建设与社会生活”“明代扬州的教育与科举”“明代扬州的文化”等九章，全面系统地叙述了元明时期扬州历史发展的基本情况，内容涉汲当时扬州的政治、经济、文化、教育等诸多方面。
《扬州通史》编纂委员会是由扬州市委、市政府主要领导及相关单位部门的专家学者组成的编纂机构。
序言
导言
第一章元代扬州的政治与军事
第一节政区沿革
一、行政机构
二、监察机构
第二节军政格局
一、省级行政机构属官
二、淮东宣慰司和江北淮东道肃政廉访司属官
三、扬州路及所属录事司、府、州、县属官的设置
四、戍守扬州的军队
第三节元末的扬州
一、元末的形势
二、元末扬州地区的攻防
三、元朝在扬州统治的终结
第二章元代扬州的经济、文化与社会生活
第一节经济发展面貌
一、农业
二、盐课与盐业
三、造船业和交通运输业
四、扬州元宝
第二节教育与文化
一、学校与科举
二、文化面貌
第三节社会生活
一、市井生活
二、名胜古迹
三、宗教与寺观
第四节元代扬州与中西交流
一、伊斯兰教遗迹
二、基督教遗迹
三、马可·波罗
第三章明代扬州的政区与政局变迁
第一节扬州的政区沿革
一、扬州府的设立及其更名
二、扬州府的政区
第二节明前期的扬州治理
一、明初扬州的荒凉
二、“靖难之役”中的扬州府
三、明前期扬州府的要案
四、明前期扬州府的灾患及其应对
五、明前期扬州的名宦
第三节明中后期的扬州政局
一、从“土木之变”到“弘治中兴”
二、武宗时期的扬州
三、世宗时期的扬州
四、神宗以降的扬州
第四章明代扬州的军事及其抗争
第一节扬州府的水陆防御体系
一、水军防御力量
二、陆军防御力量
三、水陆结合的混合防御体系
第二节扬州府的抗倭斗争
一、太祖、成祖时期扬州府的抗倭斗争
二、世宗时期扬州府的抗倭斗争
三、入犯扬州府的真倭与从倭
第三节明末扬州保卫战
一弘光政权的建立
二、史可法督师扬州
三、扬州保卫战的影响
第五章明代扬州的经济(上):农业与工商业
第一节农业
一、户口增减及其原因
二、土地垦辟与农作物种类
三、赋税与徭役
第二节水患与水利
一、河湖与水患形势
二、治水之议
三、水利建设与水患治理
四、水患频繁的原因
第三节手工业与商业
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